Кандидат юридических наук, заслуженный работник Республики Коми, заместитель Комитета Совета Федерации по социальной политике и здравоохранению, член Комиссии Совета Федерации по взаимодействию со Счетной палатой Российской Федерации.
В 1985 году Евгений Никитович назначен заместителем министра, в январе 1987 года – министром внутренних дел Коми АССР. В 1996 году присвоено звание генерал-лейтенанта милиции.
В 1999 году назначен заместителем Главы Республики Коми, председателем Государственного комитета по безопасности Республики Коми.
В 1985-1990 гг. избирался депутатом Верховного Совета Коми АССР одиннадцатого созыва.
21 декабря 2001 года был назначен представителем в Совете Федерации Федерального Собрания РФ от Государственного Совета Республики Коми, вновь был утвержден в этой должности новыми составами Госсовета Коми 17 марта 2003 года, а затем 30 марта 2007 года.
Награжден орденами Почета (1991), медалью Жукова (1995), юбилейной медалью «300 лет Российскому флоту» (1996), медалью «За отличие в охране общественного порядка» (1999), благодарность Президента Российской Федерации (2010).
Решением Совета МО ГО «Сыктывкар» от 15 июля 2008 года за большие заслуги в социально-экономическом развитии г. Сыктывкара, укрепление правопорядка и общественной безопасности Евгению Никитовичу Трофимову звание «Почетный гражданин города Сыктывкара».